- a -

• absolute : StochHMM::ExDef , StochHMM::weight
• absoluteValue : StochHMM::weight
• allowable : StochHMM::opt_parameters
• alpha : StochHMM::simpleTable< T >
• alpha_type : StochHMM::track
• alphabet : StochHMM::track
• alphabets : StochHMM::lexicalTable
• alphaIndex : trainingSeqs
• alt_scoring_current : StochHMM::trellis
• alt_scoring_previous : StochHMM::trellis
• alt_simple_stochastic_table : StochHMM::trellis
• alternatives : StochHMM::options
• amb : StochHMM::Index
• ambiguous : StochHMM::track , StochHMM::Index
• ambiguousSymbols : StochHMM::track
• array : StochHMM::dynamic_bitset , StochHMM::sparseArray< T >
• array_size : StochHMM::lexicalTable
• attrib : StochHMM::sequence , StochHMM::seqJob
• attribModelFunc : StochHMM::seqTracks
• attribTwo : StochHMM::model
• attribute : StochHMM::gff_feature
• author : StochHMM::model